SublimeLinter есть версия для 3. Для того, чтобы ее получить, нужно сделать клон Git репозиория и переключить ветку на sublime-text-3. Подробнее, к сожалению, сейчас не опишу.
Но сколько сталкивался с этим плагином, постоянно какие-то пляски с бубном.
Надеюсь, через пару дней получится выйти в рабочий режим, посмотрю конкретнее.